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| Registros recuperados : 36 | |
| 1. |  | GATTI, M.; CHUD, T. C. S.; NASCIMENTO, G. B. do; THOLON, P.; MUNARI, D. P. Principal components analysis for growth traits in Canchim cattle. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 54., 2017, Foz do Iguaçu, PR. Proceedings... Brasília, DF: SBZ, 2017. p. 505.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 4. | | CHUD, T. C. S.; VENTURA, R. V.; SCHENKEL. F. S.; URBINATI, I.; CARVALHEIRO, R.; REGITANO, L. C. de A.; MARCONDES, C. R.; MINARI, D. P. Accuracy of genotype imputation in Canchim cattle using FImpute and Beagle software., In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON ANIMAL FUNCTIONAL GENOMICS, 5., 2013, Guarujá. Abstract... Guarujá:[ s.n.], 2013. AB.20.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 5. | | OLIVEIRA JUNIOR, G. A.; CARMO, A. S.; UTSUNOMIYA, A. T. H.; CHUD, T. C. S.; REY, F. S. B.; FERRAZ, J. B. S.; SILVA, M. V. G. B. Common copy number variation regions affecting dairy traits in Gyr cattle In: ADSA ASAS JOINT ANNUAL MEETING, 2015, Orlando. Proceedings... Orlando: ADSA: ASAS, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 6. | | BUZANSKAS, M. E.; CHUD, T. C. S.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; SILVA, L. O. C. da; SILVA, M. V. G. B.; MUNARI, D. P. Breeding structure and genetic variability in nelore and gyr breeds from brazil na índia. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 55.; CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 28., 2018, Goiânia. Construindo saberes, formando pessoas e transformando a produção animal: anais eletrônicos. Goiânia: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2018.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 7. | | CHUD, T. C. S.; BICKHART, D. M.; ZERLOTINI NETO, A.; COLE, J. B.; SILVA, M. V. G. B.; MUNARI, D. P. Copy number variation in dairy cattle using next-generation sequencing. In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 26., 2018, San Diego. Abstracts... [S.l.: s.n.], 2018. 1 p. PAG 2018. P0490. Na publicação: Adhemar Zerlotini, Marcos Vinicius B. da Silva.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 8. | | CHUD, T. C. S.; SILVA, M. V. G. B.; CARMO, A. S.; SILVA, T. B. R.; OLIVEIRA JUNIOR, G. A.; REY, F. S. B.; MUNARI, D. P. Identification of copy number variation in Brazilian synthetic dairy cattle breed In: ADSA ASAS JOINT ANNUAL MEETING, 2015, Orlando. Proceedings... Orlando: ADSA: ASAS, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 9. | | ROSA, J. O.; PIRES, B. C.; CHUD, T. C. S.; BUZANSKAS, M. E.; CRUZ, V. A. R.; LEDUR, M. C.; SCHMIDT, G. S.; MUNARI, D. P. Genetic parameters reproductive traits in a strain if laying hens. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 60., 2014, Guarujá. Resumos? Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2014. p. 24| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 11. | | URBITANI, I.; BUZANSKAS, M. E.; CHUD, T. C. S.; MORKRY, F. B; HIGA, R. H.; REGITANO, L. C. de A.; MUNARI, D. P. Selection signatures in Canchim beef cattle. In:WORLD CONGRESS OF GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver. Proceedings...Vancouver: WCGALP: Amarican Society of Animal Science, 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 12. | | URBITANI, I.; BUZANSKAS, M. E.; CHUD, T. C. S.; MORKRY, F. B; REGITANO, L. C. A.; HIGA, R. H.; MUNARI, D. P. Selection signatures in Canchim beef cattle. In: WORLD CONGRESS OF GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver. Proceedings... Champaign: ASAS, 2014. Não paginado.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 13. | | CRUZ, V. A. R. da; IBELLI, A. M. G.; BUZANSKAS, M. E.; ROSA, J. O.; CHUD, T. C. S.; LEDUR, M. C.; PEIXOTO, J. de O.; MUNARI, D. P. Association of Apolipoprotein B gene with carcass, performance, and organ traits in a paternal broiler line. In: REUNIÃO ANNUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 51, 2014, Barra dos Coqueiros. Anais ... Barra dos Coqueiros: SBZ, 2014. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 14. | | ZERLOTINI NETO, A.; STAFUZZA, N. B.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; CHUD, T. C. S.; CAETANO, A. R.; MUNARI, D. P.; GARRICK, D. J.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; CARVALHO, M. R.; SILVA, M. V. G. B. Detection of potential genetic variants affecting gene function in Guzerat cattle. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 12., 2016, Belo Horizonte. Proceedings... [S.l.]: AB3C, 2016. p. 47. X-meeting 2016.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 15. | | ZERLOTINI NETO, A.; STAFUZZA, N. B.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; CHUD, T. C. S.; CAETANO, A. R.; MUNARI, D. P.; GARRICK, D. J.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; CARVALHO, M. R.; SILVA, M. V. G. B. Detection of potential genetic variants affecting gene function in Guzerat cattle. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 12., 2016, Belo Horizonte. Proceedings... [S.l.]: AB3C, 2016. p. 47. X-meeting 2016.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 16. | | JOAQUIM, L. B.; CHUD, T. C. S.; MARCHESI, J. A. P.; SAVEGNAGO, R. P.; BUZANKAS, M. E.; ZANELLA, R.; CANTAO, M. E.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C.; IRGANG, R.; MUNARI, D. P. Genomic structure of a crossbred landrace pig population. Plos One, v. 14, n.2, e0212266, 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 17. | | OLIVEIRA JÚNIOR, G. A.; CHUD, T. C. S.; VENTURA, R. V.; GARRICK, D. J.; COLE, J. B.; MUNARI, D. P.; FERRAZ, J. B. S.; MULLART, E.; DeNISE, S.; SMITH, S.; SILVA, M. V. G. B. Genotype imputation in a tropical crossbred dairy cattle population. Journal of Dairy Science, v. 100, n. 12, p. 9623-9634, 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 18. | | BRAGA, L. G.; CHUD, T. C. S.; WATANABE, R. N.; SAVEGNAGO, R. P.; SENA, T. M.; CARMO, A. S. do; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; SILVA, M. V. G. B.; MUNARI, D. P. Identification of copy number variations in the genome of Dairy Gir cattle. PLoS ONE, v. 18, n. 4, e0284085, 2023.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 19. | | RAGOGNETTI, B. do N. N; STAFUZZA, N. B.; SILVA, T. B. R. da; CHUD, T. C. S.; GRUPIONI, V. A. R.; CRUZ, V. A. R.; DANTAS, J. de O.; NONES, K.; LEDUR, M. C.; MUNARI, D. P. Genetic parameters and mapping quantitative trait loci associated with tibia traits in broilers. Genetics and Molecular Research, v. 14, n. 4, p. 17544-17554, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 20. | | VERARDO, L. L.; STAFUZZA, N. B.; MUNARI, D. P.; ZERLOTINI NETO, A.; CHUD, T. C. S.; GARRICK, D. J.; COLE, J. B.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B. A gene-transcription factor network associated with residual feed intake based on SNVs/InDels identified in Gir, Girolando and Holstein cattle breeds. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 11., 2018, Auckland. Proceedings... [S.l.: s.n.], 2018.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| Registros recuperados : 36 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
26/07/2019 |
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Data da última atualização: |
07/04/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
MARCIANO, L. E. A.; MAIA, R. de O. G.; SANTOS; DUARTE, I. N. H.; BERNARDES, P. A.; CHUD, T. C. S.; REGITANO, L. C. de A.; BUZANSKAS, M. E. |
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Afiliação: |
Luany Emanuella Araujo Marciano, UFPB; Ryan de Oliveira Gonçalves MAIA, UFPB; Marta da Silva Santos, UFPB; Igor Nelson Herculano DUARTE, UFPB; Priscila Arrigucci Bernardes, UNESP; Tatiane Cristina Seleguim CHUD, University of Guelph; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; Marcos Eli Buzangas, UFPB. |
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Título: |
Estratégias de imputação em gado Canchim utilizando população de referência da raça Nelore. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 55.; CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 28., 2018, Goiânia. Construindo saberes, formando pessoas e transformando a produção animal: anais eletrônicos. Goiânia: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2018. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
The use of genomic tools in animal breeding has been widely applied to improve productivity. Imputation methods could be used to reduce genotyping costs and increase the amount of genomic information, which are needed for various studies. The aim of this study was to consider the Canchim cattle (a composite beef breed) as target population and the Nelore breed as reference population to evaluate the imputation accuracy. A total of 285 Canchim, 114 MA genetic group and 814 Nelore animals were used in this study. Imputation was carried out using the FImpute software and genotype imputation accuracy was measured by concordance rate (CR) and allelic R square (R2). Five imputation scenarios were tested and CR results varied from 64.71% to 89.69%. The R2 varied from 0.63 to 0.91. High accuracy was obtained in the scenario considering Nelore and Canchim as reference population and MA animals as target. Despite of presenting acceptable accuracies, which indicates the possibility of using Nelore genotypes for imputing genetic markers in Canchim and MA animals, other studies should be carried out to evaluate different reference populations to obtain greater accuracies. |
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Palavras-Chave: |
Marcadores moleculares; Raça composta. |
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Thesagro: |
Bovino; Gado de Corte; Melhoramento Genético Animal; Reprodução Animal. |
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Thesaurus NAL: |
Animal breeding; Beef cattle. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/199874/1/2018-trab-0112.pdf
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Marc: |
LEADER 02258nam a2200289 a 4500
001 2110873
005 2020-04-07
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100 1 $aMARCIANO, L. E. A.
245 $aEstratégias de imputação em gado Canchim utilizando população de referência da raça Nelore.$h[electronic resource]
260 $aIn: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 55.; CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 28., 2018, Goiânia. Construindo saberes, formando pessoas e transformando a produção animal: anais eletrônicos. Goiânia: Sociedade Brasileira de Zootecnia$c2018
520 $aThe use of genomic tools in animal breeding has been widely applied to improve productivity. Imputation methods could be used to reduce genotyping costs and increase the amount of genomic information, which are needed for various studies. The aim of this study was to consider the Canchim cattle (a composite beef breed) as target population and the Nelore breed as reference population to evaluate the imputation accuracy. A total of 285 Canchim, 114 MA genetic group and 814 Nelore animals were used in this study. Imputation was carried out using the FImpute software and genotype imputation accuracy was measured by concordance rate (CR) and allelic R square (R2). Five imputation scenarios were tested and CR results varied from 64.71% to 89.69%. The R2 varied from 0.63 to 0.91. High accuracy was obtained in the scenario considering Nelore and Canchim as reference population and MA animals as target. Despite of presenting acceptable accuracies, which indicates the possibility of using Nelore genotypes for imputing genetic markers in Canchim and MA animals, other studies should be carried out to evaluate different reference populations to obtain greater accuracies.
650 $aAnimal breeding
650 $aBeef cattle
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700 1 $aMAIA, R. de O. G.
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700 1 $aREGITANO, L. C. de A.
700 1 $aBUZANSKAS, M. E.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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